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Grado en Bioinformática

Plan de estudios

El Grado en Bioinformática ofrece una formación integral a través de distintas materias informáticas y científicas partiendo de una base sólida en biología. Las asignaturas optativas aportan conocimientos complementarios en áreas como la agronomía, la investigación farmacéutica o la informática de alto rendimiento.

El currículum incluye asimismo la posibilidad de realizar prácticas externas, de elegir asignaturas optativas de las universidades que ofrecen el Grado en Bioinformática y de estudiar en una universidad extranjera.

Estructura de créditos

CRÉDITOS ECTS TOTAL
Asignaturas básicas 48 - - 48
Asignaturas obligatorias 12 60 24 96
Asignaturas optativas - - 20 20
Trabajo de Fin de Grado - - 16 16
Total 60 60 60 180

Asignaturas

Los alumnos de ESCI-UPF puede elegir las asignaturas en SIGMA 

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Curso:
Trimestre:
Tipo de asignatura:
Código de color
  • Básica
  • Obligatoria
  • Optativa

Código: 51104

Curso:

Cálculo

Código: 51104

Cálculo
Profesor/a:
Descripción

Análisis de funciones reales de una o más variables: continuidad, diferenciación e integración, con ejemplos de funciones de uso generalizado en estadística e informática. Estudio de secuencias, límites y series. Criterios para valores extremos. Ecuaciones diferenciales y sus aplicaciones en el modelado bioinformático.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 6 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Básica

Código: 51310

Curso:

Álgebra

Código: 51310

Álgebra
Profesor/a:
Descripción

Estudio de espacios vectoriales y aplicaciones lineales (sistemas de ecuaciones lineales, rango y determinante de matrices, valores propios y vectores propios) y otros campos relacionados con la bioinformática: álgebra lineal numérica, descomposiciones de matrices, matriz de Markov y sistemas dinámicos discretos.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código: 51205

Curso:

Bioestadística y análisis de datos

Código: 51205

Bioestadística y análisis de datos
Profesor/a:
Descripción

Introducción a la probabilidad y la bioestadística haciendo uso de datos bioinformáticos reales. Partiendo de una pregunta de investigación bioestadística, la asignatura se centra en el diseño de un estudio científico y en la obtención de datos significativos. El curso abarca los conceptos básicos de probabilidad, así como los principios fundamentales de estimación y pruebas de hipótesis. Se introduce el lenguaje de programación R para explorar y visualizar datos y para llevar a cabo análisis estadístico básico.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Modelos estadísticos y procesos estocásticos

Código:

Modelos estadísticos y procesos estocásticos
Descripción

Esta asignatura está enfocada a los conceptos necesarios para entender métodos bioinformáticos, como el modelo oculto de Markov (HMM, Hidden Markov Model) o el modelo lineal generalizado (GLM, Generalized Linear Model), usados en el análisis de datos de secuenciación masiva de nueva generación. Desarrollo y profundización de los conceptos de probabilidad y estadística introducidos anteriormente. Los temas principales incluyen: distribución de probabilidad, conceptos de convergencia y resultados basados en grandes tamaños de muestra; procesos estocásticos, matriz de probabilidades de transición y cadenas de Markov; máxima verosimilitud y estimación bayesiana; pruebas de razón de verosimilitud, y problemas en comparaciones múltiples.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Matemáticas discretas y optimización

Código:

Matemáticas discretas y optimización
Descripción

Este curso estará dedicado a las principales herramientas de optimización utilizadas en matemática numérica, desde el punto de vista de los problemas tanto continuos como discretos. Para ello, será necesaria una profunda comprensión de grafos y problemas combinatorios.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Aprendizaje estadístico

Código:

Aprendizaje estadístico
Descripción

Este curso presenta técnicas para modelar y analizar datos complejos, incluidos los conjuntos de Big Data, haciendo hincapié en su aplicación al análisis de los datos ómicos. El curso se compone de tres grandes áreas: 1) modelado estadístico, incluidos los modelos lineales y modelos lineales generalizados ampliamente utilizados en transcriptómica; 2) aprendizaje supervisado, que cubre una amplia gama de técnicas de clasificación y predicción, y 3) aprendizaje no supervisado, que se refiere a las técnicas de visualización de datos en métodos de reducción de dimensionalidad (por ejemplo, PCA) o agrupación para encontrar patrones en los datos.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código: 51103

Curso:

Programación y algoritmos I

Código: 51103

Programación y algoritmos I
Profesor/a:
Descripción

Programación y algoritmos I y II abarcan los conocimientos esenciales sobre algoritmos y estructuras de datos, con especial énfasis en los algoritmos fundamentales y las estructuras básicas de control y aplicaciones. Se adopta principalmente el paradigma imperativo y se introduce el diseño orientado a objetos. Como lenguajes de programación se proponen inicialmente Python y, en menor medida, para poder discutir aspectos de implementación y eficiencia, C++.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 6 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Básica

Código:

Curso:

Programación y algoritmos II

Código:

Programación y algoritmos II
Descripción

Programación y algoritmos I y II abarcan los conocimientos esenciales sobre algoritmos y estructuras de datos, con especial énfasis en los algoritmos fundamentales y las estructuras básicas de control y aplicaciones. Se adopta principalmente el paradigma imperativo y se introduce el diseño orientado a objetos. Como lenguajes de programación se proponen inicialmente Python y, en menor medida, para poder discutir aspectos de implementación y eficiencia, C++.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Algoritmos y estructuras de datos

Código:

Algoritmos y estructuras de datos
Descripción

Esta asignatura profundiza en la noción de eficiencia algorítmica y en las técnicas para analizarla y mejorarla. Se explican las principales técnicas de diseño de algoritmos eficientes (greedy, divide-and-conquer, programación dinámica, backtracking, entre otras) y se ofrece una breve introducción a la intratabilidad algorítmica. Se introducen también estructuras de datos más avanzadas, como grafos, árboles y heaps, así como los principales algoritmos asociados y algunas aplicaciones.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Bases de datos

Código:

Bases de datos
Descripción

Esta asignatura presenta la noción de base de datos y su necesidad en problemas reales de gestión de la información. Se cubre en detalle el modelo relacional (SQL), así como su integración en sistemas de información y su uso programático, incluyendo aspectos de transaccionalidad, integridad y administración. Se cubren en menor detalle otros tipos de bases de datos (data warehouses, NoSQL, textuales, etc.).

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Ingeniería de software

Código:

Ingeniería de software
Descripción

Este curso se centra en los conceptos de sistemas distribuidos y los componentes básicos de los sistemas basados en la web. Desarrollo de aplicaciones web y los lenguajes y herramientas que se utilizan para desarrollar contenido dinámico. Interfaz de servicios web con bases de datos. El uso de la tecnología de virtualización para proporcionar servicios. Servicio en la nube y modelos de despliegue.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Sistemas distribuidos y tecnologías web

Código:

Sistemas distribuidos y tecnologías web
Descripción

Este curso trata las metodologías de desarrollo de software. Las necesidades y restricciones en su diseño, la implementación de software y su validación. Se presta especial atención al diseño orientado a objetos. Aplicaciones y buenas prácticas en este campo.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código: 51102

Curso:

Introducción a la biología

Código: 51102

Introducción a la biología
Profesor/a:
Descripción

Este curso proporciona los conceptos y temas fundamentales en Biología, de los componentes moleculares básicos de la vida a la biología celular, molecular y genética. Los temas incluyen la estructura y función del ADN, ARN, proteínas o componentes celulares. También aporta nociones de los mecanismos básicos como la fotosíntesis, la glucólisis, el ciclo celular, la herencia y la reproducción, así como los conceptos e ideas sobre el origen de la vida y la evolución.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 6 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Básica

Código: 51207

Curso:

Elementos de fisicoquímica y química orgánica

Código: 51207

Elementos de fisicoquímica y química orgánica
Profesor/a:
Descripción

Este curso proporciona los conceptos fundamentales de la fisicoquímica orgánica, incluyendo la termodinámica química, la química de las reacciones ácido-base y la quimioinformática. Los temas incluyen la estructura molecular y la estereoquímica, mecanismos de reacción y equilibrio químico, así como los compuestos orgánicos de base.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 6 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Básica

Código: 51206

Curso:

Biología molecular y celular

Código: 51206

Biología molecular y celular
Profesor/a:
Descripción

Este curso cubre los principios básicos de la estructura y función de la célula, tanto células procariotas como eucariotas. Incluye asimismo los temas del citoesqueleto, el retículo endoplásmico, lisosomas, cromosoma, núcleo y orgánulos citoplasmáticos. Se exploran además los mecanismos moleculares de la replicación, transcripción y traducción, así como su regulación y control.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 6 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Básica

Código: 51308

Curso:

Genética y genómica

Código: 51308

Genética y genómica
Profesor/a:
Descripción

En este curso se examinan los conceptos básicos de la genética y la herencia. Aborda desde los temas avanzados sobre la estructura y función de los genes, cromosomas y genomas hasta las metodologías básicas y las principales aplicaciones en ciencias de la vida.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 6 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Básica

Código:

Curso:

Biofísica

Código:

Biofísica
Descripción

Este curso introduce a los alumnos en los conceptos básicos de la biofísica. Los temas incluyen desde las metodologías aplicadas en este campo hasta la estructura y la energética de proteínas y ácidos nucleicos, las biomembranas, el plegamiento de proteínas, las interacciones moleculares y las redes biológicas. Además, también cubre los detalles de los repositorios de energía biológica.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código: 51311

Curso:

Introducción a las ciencias de la salud

Código: 51311

Introducción a las ciencias de la salud
Profesor/a:
Descripción

Este curso es una introducción a los campos de las  ciencias de la salud, tanto en las prácticas terapéuticas y preventivas como clínicas, con especial énfasis en temas relacionados con el pensamiento crítico y la resolución de problemas. Modelos de investigación y tendencias en ciencias de la salud. El curso revisa conceptos básicos de las ciencias de la salud y su relación con la causalidad y prevención de enfermedades.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Bioinformática estructural

Código:

Bioinformática estructural
Descripción

Esta asignatura versa sobre el análisis y la predicción de la estructura tridimensional de macromoléculas biológicas tales como proteínas, ARN y ADN. Trata generalizaciones de la estructura macromolecular en 3D, como comparaciones de plegamientos generales y motivos locales, los principios de plegamiento molecular, la evolución y las interacciones de uniones, y las relaciones estructura/función, todo ello trabajando tanto con las estructuras resueltas experimentalmente como con modelos computacionales.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Genómica computacional

Código:

Genómica computacional
Descripción

En la genómica computacional se llevan a cabo análisis computacionales para entender la biología de las secuencias de los genomas en estudio (ADN, ARN, datos de microarrays…). Con un enfoque eminentemente genómico, el objetivo es aplicar métodos computacionales para entender la estructura y función de las secuencias. Se pondrá especial énfasis en el proceso de anotación de los elementos funcionales a nivel genómico.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Algoritmos para análisis de secuencias en bioinformática

Código:

Algoritmos para análisis de secuencias en bioinformática
Descripción

Esta assignatura presenta los principales métodos para anàlisis de secuencias en bioinformàtica. Se incluyen  por lo menos  Viterbi, Baum-Welsch, decodificación posterior, SCFG aplicado al plegamiento de ARN, algoritmos de predicción de genes, Infernal (INFERence of RNA ALignment software), algoritmos de predicción de estructura secundaria en proteínas y algoritmos, perfiles de dominio, algoritmos HMM y métodos para predicción de genes.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Algoritmos y métodos de agrupamiento en genómica y evolución

Código:

Algoritmos y métodos de agrupamiento en genómica y evolución
Descripción

Esta asignatura trata de programación dinámica, búsqueda en bases de datos (BLAST), búsqueda de subcadenas basada en la compresión (alineadores de ADN), algoritmos de ensamblaje, alineamiento de secuencias múltiples, algoritmos de plegamiento de ARN (Zuker, Nussinov), algoritmos de superposición estructurales. Algoritmos de ensamblaje, gráficos de Bruijn. Usearch, UPGMA, NJ, ML y árboles de parsimonia, y métodos bayesianos de reconstrucción filogenética.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Visualización de datos

Código:

Visualización de datos
Descripción

Esta asignatura introduce conceptos del diseño visual y de las metáforas de datos esenciales para el diseño y uso de software interactivo específico de la bioinformática. Se incluyen conceptos como: espacios de color; mapas de bits y gráficos vectoriales (PostScript, SVG); 2D & 3D Rendering; lenguaje de programación Processing, y gramática de gráficos (R, ggplot). La visualización de datos en bioinformática: anotaciones de genomas y navegadores; estructura de visualizadores; herramientas de manipulación de redes. Hive Plots. Bibliotecas gráficas.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Computación de alto rendimiento

Código:

Computación de alto rendimiento
Descripción

Este curso se centra en los conceptos de  concurrencia y procesamiento paralelo. Los problemas lógicos asociados a la concurrencia y soluciones. Arquitecturas paralelas y modelos de programación: memoria compartida y transmisión de mensajes. Identificación de paralelismo en aplicaciones, métodos de sincronización, el análisis de la dependencia, la programación de tareas, la comunicación y operaciones colectivas e I/O paralelo. Muestra cómo medir el rendimiento y el consumo de energía de las aplicaciones paralelas. Herramientas, lenguajes de programación, bibliotecas y macros. Computación en clústers y entornos de tipo Hadoop.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Bases de datos públicas de ciencias de la salud y de la vida

Código:

Bases de datos públicas de ciencias de la salud y de la vida
Descripción

Este curso introducirá los diferentes tipos de datos presentes en las ciencias de la salud y de la vida, destacando sus características específicas, su heterogeneidad y la necesidad de integración con el fin de resolver cuestiones científicas y clínicas. Los principales portales y bases de conocimiento para acceder y explotar este tipo de datos se presentarán en sesiones prácticas para proporcionar a los alumnos los conocimientos necesarios para utilizar todos estos recursos.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Técnicas ómicas

Código:

Técnicas ómicas
Descripción

Este curso es una introducción a los extensos detalles de las metodologías de alto rendimiento con tecnología de última generación utilizados en biología: tecnologías de secuenciación de ADN y ARN, ChIP-seq, rayos X, RMN y espectrometría de masas. Por otra parte, el curso también examina la información técnica para una comprensión global de la distribución de errores y sesgos de los datos experimentales.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Genética de poblaciones y evolución molecular

Código:

Genética de poblaciones y evolución molecular
Descripción

Este curso se centra en los conceptos fundamentales de la evolución de secuencia de ADN y proteínas, desde la variación intrapoblacional hasta la comparación de especies, así como sus aplicaciones básicas. Los temas incluyen el equilibrio de Hardy-Weinberg, desequilibrio de ligamiento y cartografía génica, la teoría de la coalescencia o pruebas basadas en la neutralidad y la reconstrucción filogenética. También se exploran los principales algoritmos informáticos y software para entender los patrones y procesos subyacentes en la evolución de secuencia de ADN (y proteína), así como para construir árboles filogenéticos.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Genómica comparativa y funcional

Código:

Genómica comparativa y funcional
Descripción

En esta asignatura se tratan conceptos de la genómica comparada y funcional. Los principales elementos del temario son: duplicación génica y genómica; genoma y reordenamientos cromosómicos; sintenia; origen de los genes; estimación de la tasa de ganancia y pérdida génica; inferir la selección natural en secuencias codificantes y no codificantes; secuencias conservadas; sesgo de codones; convergencia funcional; coevolución molecular; los análisis de los ARN no codificantes; genómica comparativa y biología de sistemas; anotación funcional; proyecto ENCODE, y expresión génica.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Biología de sistemas y redes

Código:

Biología de sistemas y redes
Descripción

Este curso es una introducción al análisis de redes y métodos estadísticos utilizados en la biología de sistemas contemporánea, la investigación bioinformática y la farmacología de sistemas.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código: 51101

Curso:

Introducción a la bioinformática

Código: 51101

Introducción a la bioinformática
Profesor/a:
Descripción

Aspectos generales de funcionamiento de la Universidad y características de las titulaciones impartidas. Estrategias de estudio, técnicas de aprendizaje y consulta de información. Situación actual, áreas de conocimiento y desafíos presentes en el sector profesional y productivo de la bioinformática. Campos de investigación básica y aplicada relevantes en el contexto de la bioinformática y la biomedicina. Introducción intuitiva a varios conceptos, fenómenos, principios o métodos que se estudian en bioinformática con la finalidad de exponer a los estudiantes a problemas reales, de ayudarles a interpretar los fenómenos biológicos y su formulación matemática y de contribuir a confirmar/reforzar su vocación por la bioinformática y la investigación biomédica. 

Curso:

Trimestre: /

Créditos: 6 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Básica

Código:

Curso:

Gestión y emprendeduría

Código:

Gestión y emprendeduría
Descripción

Gestión de proyectos: ámbito de aplicación del proyecto; integrar la planificación, organización, motivación y control de los recursos; optimizar e integrar la asignación de entradas; enlazar diferentes organizaciones; liderazgo y gestión de equipos; el valor añadido; comunicación; control de calidad; la gestión del riesgo.

Emprendeduría: identificar, desarrollar y crear oportunidades de mercado; comercializar oportunidades; llevar a cabo nuevas iniciativas de negocio y comenzar con expectativas de éxito; las oportunidades de financiación; evaluación y benchmarking; las habilidades de liderazgo, fortalecer la confianza en uno mismo y reducir la aversión al riesgo; trabajar en equipos autogestionados; liderazgo eficiente; trabajar en un mundo globalizado y multilingüe; la importancia del networking; la sociedad del conocimiento y la innovación; emprendeduría social.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Trabajo de Fin de Grado (TFG)

Código:

Trabajo de Fin de Grado (TFG)
Descripción

Ejercicio original, a presentar y defender ante un tribunal universitario, consistente en un proyecto integral del ámbito de las tecnologías específicas de la bioinformática, de naturaleza científico-profesional, en el que se sinteticen las competencias adquiridas. Debe ser un trabajo de carácter innovador de desarrollo de una idea, un programa informático o un modelo científico para un problema biomédico o un fenómeno biológico. El TFG está orientado a la evaluación de competencias asociadas al título y concluye con su defensa y la aprobación. Las normas de presentación del TFG vendrán determinadas en el Plan docente de la materia.

Curso:

Trimestre: /

Créditos: 16 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Obligatoria

Código:

Curso:

Técnicas de imagen biomédica

Código:

Técnicas de imagen biomédica
Descripción

Este curso tiene por objetivos describir los principios de técnicas de imagen digital; describir las propiedades de las imágenes digitales y los métodos de mejora de imagen; describir los principales métodos utilizados para la reconstrucción y el análisis de imágenes, y comprender cómo las técnicas de imagen biomédica se utilizan en la investigación biológica y la práctica clínica. Asimismo, aprender a emplear herramientas de procesamiento de imagen para realizar un análisis básico de imágenes biomédicas.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Optativa

Código:

Curso:

Agrogenómica

Código:

Agrogenómica
Descripción

Este curso proporciona los conceptos y métodos fundamentales que subyacen en la mejora genética de plantas y animales, en los que se utilizan tanto métodos clásicos como técnicas modernas de selección genómica. Los temas que se abordarán incluyen los principios de la genética estadística y cuantitativa, el modelo infinitesimal, heredabilidad, el mestizaje y la depresión endogámica. Predicción del mérito genético basado en pedigrí (BLUP) y haciendo uso de la información molecular de genomas completos (modelos bayesianos y de paso único). También se ocupará de los principales algoritmos para simular los programas de mejora y programas informáticos utilizados en los esquemas comerciales. Este curso tendrá un fuerte componente industrial y trataremos de invitar a profesionales de empresas internacionales de cría.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Optativa

Código:

Curso:

Epidemiología genética

Código:

Epidemiología genética
Descripción

Principios, métodos y desafíos para el estudio de la genética de enfermedades complejas utilizando estudios de asociación. Estrategias de diseño de los estudios epidemiológicos. La selección de genes candidatos. GWAS. El desequilibrio de ligamiento y estratificación de la población. Análisis de alelos, de genotipos y  de haplotipos. Heredabilidad faltante. Interacciones gen-ambiente y gen-gen. Variantes raras.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Optativa

Código:

Curso:

Introducción al I+D farmacéutico

Código:

Introducción al I+D farmacéutico
Descripción

El desarrollo de un nuevo medicamento para una enfermedad o condición clínica es un proceso complejo que implica el esfuerzo de muchos profesionales con experiencia diversa y en el que la bioinformática desempeña un papel importante. En este curso se pretende dotar a los alumnos de un conocimiento general sobre las diferentes etapas de descubrimiento y desarrollo de fármacos: desde la identificación inicial y validación de objetivos, pasando por el desarrollo del ensayo, el cribado de alto rendimiento, la fase “prototipo-al-líder”, la selección de una molécula candidata para el desarrollo clínico, las fases de los ensayos clínicos y la aprobación final de fármacos.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Optativa

Código:

Curso:

Quimiogenómica

Código:

Quimiogenómica
Descripción

Polifarmacología para medicamentos. Predicción a gran escala de afinidades de medicamentos. Métodos de deconvolución en el cribado fenotípico. Biblioteca de diseño óptimo con la máxima cobertura espacio-objetivo. Estrategias de eliminación de riesgo en biología química. Predicción a gran escala de seguridad de los medicamentos. Reutilización de medicamentos. Visualización de datos quimiogenómicos.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Optativa

Código:

Curso:

Filogenética molecular y genómica evolutiva

Código:

Filogenética molecular y genómica evolutiva
Descripción

Modelos de evolución molecular (ADN y proteínas; avanzado). Alineamientos múltiples de secuencias y genomas. Evaluación filogenética de alineamientos. Filogenia molecular (reconstrucción de árboles filogenéticos usando MP, BI, ML). Comparación del soporte de un árbol filogenético y de su topología. El desarrollo de marcadores moleculares. La duplicación génica. Inferir relaciones de ortología y paralogía. Filogenómica y evolución genómica. Árbol de genes y de especies. La especiación genética/genómica. Análisis evolutivo de las redes de interacción gen-gen y proteína-proteína.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Optativa

Código:

Curso:

Temas actuales de investigación en bioinformática

Código:

Temas actuales de investigación en bioinformática
Descripción

Seminarios presentados por ponentes invitados y por los propios estudiantes. Con el objetivo de acercar a los alumnos a la investigación interdisciplinar en bioinformática, estos seminarios abordarán temas actuales de investigación en bioinformática. Los temas pueden incluir: análisis de genomas, regulación genómica, estudios de asociación, variación estructural, organismos modelo y tecnologías genómicas. También se tratarán técnicas computacionales que incluyen la estadística y la informática, como Big Data y minería de datos. Los materiales de lectura incluyen artículos originales y revisiones.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Optativa

Código:

Curso:

Profundización en programación, algoritmos y estructuras de datos

Código:

Profundización en programación, algoritmos y estructuras de datos
Descripción

Más sobre el análisis de programas. Quicksort y su tiempo de duración promedio. Heaps. Búsqueda de cadenas. Esquemas algorítmicos: greedy, divide-and-conquer, búsqueda exhaustiva, programación dinámica. Incomputabilidad, indocilidad. Los enfoques para tratar la complejidad: aproximación y algoritmos aleatorios. Programación lineal, cuadrática y programación convexa. Introducción al análisis sintáctico.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Optativa

Código:

Curso:

Architecture-aware Programming

Código:

Architecture-aware Programming
Descripción

Este curso se centra en las técnicas para optimizar el código escrito en lenguajes de alto nivel como C / C ++ y FORTRAN. Presenta las técnicas utilizadas para análisis de rendimiento y el uso del compilador y sus optimizaciones, alternativas para la optimización del flujo de control, la reducción de las instrucciones de salto, desenroscado de bucles, función inline, reducción de los accesos a memoria, TLB y fallos de caché, técnicas de bloqueo y el uso de vectorización. Análisis del comportamiento dinámico del programa, análisis del código de máquina generado y herramientas para identificar los cuellos de botella.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Optativa

Código:

Curso:

Ontologías en las ciencias de la salud y de la vida

Código:

Ontologías en las ciencias de la salud y de la vida
Descripción

Esta asignatura trabaja en profundidad los términos, conceptos, métodos y aplicaciones en el campo de las ontologías en las ciencias de la salud y de la vida. El temario incluye: contexto sintáctico y semántico de las ontologías en las ciencias de la salud; estructuras de registros jerárquicos; relaciones y espacios de nombres; lenguajes de marcas; esquema XML; RDF (Resource Description Framework); la codificación de la información en XML y RDF; web semántica; ontologías en bioinformática; campos de ontologías específicas; recuperación de información y lenguajes de consulta; analizadores y validadores; transformación y presentación de la información.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 4 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Optativa

Código:

Curso:

Prácticas optativas

Código:

Prácticas optativas
Descripción

Los alumnos que así lo deseen pueden realizar un período de prácticas en una empresa o institución pública o privada relacionada con ámbitos afines al Grado en Bioinformática. Dichas prácticas deberán tener una duración equivalente a 20 ECTS. Un 60 % aproximado del tiempo corresponde a la actividad presencial del estudiante o la estudiante en la empresa o institución. El porcentaje restante se distribuye entre asistencia a tutorías y el trabajo autónomo del estudiante, consistente en elaborar una memoria conforme a la estructura propuesta en la guía docente de la asignatura.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 20 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Optativa

Código: 51309

Curso:

Teoría de la información, arquitectura de ordenadores y sistemas operativos

Código: 51309

Teoría de la información, arquitectura de ordenadores y sistemas operativos
Profesor/a:
Descripción

Este curso abarca la representación de la información en el sistema binario, la aritmética de enteros y de punto flotante y los elementos de un ordenador: procesadores, jerarquía de memorias, buses y el subsistema I/O, para entender cómo se ejecutan los programas en un sistema, lenguajes de alto y bajo nivel y conceptos de sistemas operativos: llamadas al sistema, gestión de la memoria y de procesos, programación de subprocesos e I/O.

Curso:

Trimestre:

Créditos: 6 ECTS

Idioma: Inglés

Tipo de asignatura:

  • Básica