Genómica computacional

Asignatura del Grado en Bioinformática

Información académica

Código:
53129

Créditos:
5 ECTS

Idioma:
Inglés

Tipo de asignatura: Obligatoria

Descripción

En la genómica computacional se llevan a cabo análisis computacionales para entender la biología de las secuencias de los genomas en estudio (ADN, ARN, datos de microarrays…). Con un enfoque eminentemente genómico, el objetivo es aplicar métodos computacionales para entender la estructura y función de las secuencias. Se pondrá especial énfasis en el proceso de anotación de los elementos funcionales a nivel genómico.

Asignatura perteneciente al Grado en Bioinformática, si lo deseas puedes consultar la información completa del curso.

Profesor/a Cargo

Josep Francesc Abril

Profesor

Titulación:

Doctor en Ciencias de la Salud y de la Vida (UPF)
Licenciado en Biología, especialidad Fundamental (UB)

Biografía:

Su labor de investigación se centra en el análisis computacional de secuencias para la realización y anotación de proyectos ómicos, desde el ensamblaje hasta la descripción funcional de genes y genomas, pasando por la integración en redes de interacción, el modelado de señales eucarióticas y estructuras génicas, la visualización de rasgos genómicos (como en el caso del mapa del genoma humano del artículo publicado en Science en el año 2001), la descripción de comunidades víricas a partir de muestras metagenómicas, etc. Sus organismos favoritos son las planarias, las moscas y los seres humanos, aunque no necesariamente en este orden. Ha participado en proyectos para evaluar la fiabilidad de los programas de predicción de genes, como GASP en la mosca y EGASP/RGASP en humanos.

Cinta Pegueroles

Profesora

Datos de contacto:
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Titulación:

Doctora en Genética (UB)

Biografía:

Maria Cinta Pegueroles es graduada en Biología (2006) y doctora en Genética (2010) por la Universitat de Barcelona (UB). Ha trabajado como investigadora posdoctoral en la Fundació Institut Hospital del Mar d’Investigacions Mèdiques (FIMIM), en el Parc Científic de Barcelona (PCB), el Vall d’Hebron Institut de Recerca (VHIR) y el Centre de Regulació Genòmica (CRG), y como ingeniera de investigación en el Barcelona Supercomputing Center (BSC). Actualmente es profesora asociada en la Universitat de Barcelona y profesora colaboradora en la Universitat Oberta de Catalunya.

Bióloga especializada en genética y bioinformática, sus principales intereses en el campo de la investigación son la genómica, la evolución y la adaptación de poblaciones. Su objetivo general es entender cómo evolucionan los genomas utilizando datos a gran escala; en particular, está interesada en coprender las bases genéticas de la adaptación y descifrar la funcionalidad de los genes largos no codificantes, así como su papel en la evolución y adaptación del genoma. Para ello, utiliza tanto una perspectiva evolutiva que proporciona información de eventos antiguos como una perspectiva poblacional que aporta datos sobre eventos más recientes.