Marta Coronado

Aquest curs se centra en els conceptes fonamentals de l’evolució de seqüència d’ADN i proteïnes, des de la variació intrapoblacional fins a la comparació d’espècies, així com les seves aplicacions bàsiques. Els temes inclouen l’equilibri de Hardy-Weinberg, desequilibri de lligament i cartografia gènica, la teoria de la coalescència o proves basades en la neutralitat i la reconstrucció filogenètica. També s’exploren els principals algoritmes informàtics i programari per entendre els patrons i els processos subjacents en l’evolució de seqüència d’ADN (i proteïna), així com per construir arbres filogenètics.

Aquesta assignatura introdueix conceptes del disseny visual i de les metàfores de dades essencials per al disseny i l’ús de programari interactiu específic de la bioinformàtica. S’inclouen conceptes com:  espais de color; mapes de bits i gràfics vectorials (PostScript, SVG); 2D & 3D Rendering; llenguatge de programació Processing; i gramàtica de gràfics (R, ggplot). La visualització de dades en bioinformática: anotacions de genomes i navegadors; estructura de visualitzadors; eines de manipulació de xarxes. Hive Plots. Biblioteques gràfiques.