Algoritmos para análisis de secuencias en bioinformática
Información académica
Código:
52115
Créditos:
4 ECTS
Idioma:
Inglés
Descripción
Esta assignatura presenta los principales métodos para anàlisis de secuencias en bioinformàtica. Se incluyen por lo menos Viterbi, Baum-Welsch, decodificación posterior, SCFG aplicado al plegamiento de ARN, algoritmos de predicción de genes, Infernal (INFERence of RNA ALignment software), algoritmos de predicción de estructura secundaria en proteínas y algoritmos, perfiles de dominio, algoritmos HMM y métodos para predicción de genes.
Arnau Cordomí
Coordinador
Doctor en Ingeniería Química (UPC)
Licenciado en Ciencias Químicas (UB)
Arnau Cordomí es coordinador académico y profesor en ESCI-UPF en el área de Bioinformática. Doctor en Polímeros y Biopolímeros por la Universitat Politècnica de Catalunya (2008) y licenciado en Ciencias Químicas por la Universitat de Barcelona (2001), su investigación se enmarca dentro del campo de la bioinformática estructural y está centrada en el estudio de las proteínas de membrana y, en particular, de los receptores acoplados a proteínas G (GPCRs), una superfamilia de proteínas de membrana crucial en la comunicación celular y que incluye las dianas farmacológicas más importantes. Utiliza herramientas computacionales en el marco de la bioinformática estructural para realizar predicciones de cómo funcionan las proteínas a nivel molecular. Ha participado en proyectos de investigación financiados por varias instituciones públicas y privadas. Es autor de más de 60 artículos en revistas indexadas.
Fernando Cruz
Profesor
Licenciado en Biología (Universidad de Vigo)
Máster en Genética de Poblaciones (Universidad de Vigo)
Doctorado en Biología Molecular y Genética (Universidad de Vigo)
Fernando Cruz obtuvo su doctorado en el Departamento de Genética de la Universidad de Vigo. Posteriormente, trabajó como investigador posdoctoral durante siete años, a lo largo de los cuales fue adquiriendo amplios conocimientos y experiencia en bioinformática, programación y genómica, primero en el Smurfit Institute of Genetics (TCD, Irlanda), en segundo lugar en el EBC de la Universidad de Uppsala (Suecia), en tercer lugar en el Evolutionary Bioinformatics Laboratory de Lausanne (Suiza) y por último en la Estación Biológica de Doñana (EBD-CSIC, España). Desde el año 2014 es bioinformático en genómica en el equipo de Ensamblaje y Anotación del Genoma en el Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG).