José Francisco Sánchez Herrero

Dades de contacte:

Càrrec

Profesors

Titulació

Llicenciatura en Biologia (Universitat d’Alacant)
Màster en Bioinformàtica per a les Ciències de la Salut (UPF-UB)
Postgrau en Filogènies i Genealogies de l’ADN (UB)
Doctorat en Genètica (UB)

Biografia

José Francisco Sánchez Herrero treballa com a tècnic bioinformàtic a la unitat de Bioinformàtica de l’IGTP duent a terme projectes de recerca i d’anàlisi (genòmics, transcriptòmics, epigenètics, etc.) que els diferents investigadors i usuaris requereixen. Utilitza llenguatges de programació (Python, R, Shell) en entorns Linux/Mac/Windows i clústers de computació. A més, és professor associat de la UAB en tasques docents relacionades amb la genètica, la genòmica i la bioinformàtica, i participa també com a professor col·laborador i mentor en el Màster en Bioinformàtica i Bioestadística de la UOC-UB.

Assignatura que imparteix

Assignatura

Programa

Tipologia

Visualització de dades

Grau en Bioinformàtica

Obligatòria

Programa:
Grau en Bioinformàtica

Descripció

Aquesta assignatura introdueix conceptes del disseny visual i de les metàfores de dades essencials per al disseny i l’ús de programari interactiu específic de la bioinformàtica. S’inclouen conceptes com: espais de color; mapes de bits i gràfics vectorials (PostScript, SVG); 2D & 3D Rendering; llenguatge de programació Processing; i gramàtica de gràfics (R, ggplot). La visualització de dades en bioinformática: anotacions de genomes i navegadors; estructura de visualitzadors; eines de manipulació de xarxes. Hive Plots. Biblioteques gràfiques.

Codi:
53128

Créditos:
4 ECTS

Idioma:
Anglès

Tipus d'assignatura: Obligatòria